研究队伍

叶武威

1. 个人简历:

叶武威,男,浙江杭州人,博士,研究员,博士生导师,中国农业科学院棉花研究所品种资源研究室副主任,国际棉花基因组委员会(ICGI)育种与应用基因组(Breeding & Applied Genomics)主席,中国农业科学院棉花研究所抗逆鉴定课题组组长,中国农学会棉花分会理事,中国作物学会棉花专业委员会理事。1990年至今一直从事于棉花种质资源抗逆性如耐盐性、抗旱性的鉴定、创新及其抗性基础研究工作。主要研究棉花种质鉴定、创新利用与棉花资源生物多样性研究、抗性种质资源细胞遗传、分子遗传研究和抗性基因克隆表达等。主要承担国家“973”、“863”、国家科技攻关、国家棉花转基因专项、国家棉花产业体系、科技支撑计划等项目。首先提出了0.4%盐量胁迫法和3%土壤干旱胁迫法(叶武威等,1994),制订了国家行业标准(NY/T2323-2013),拥有盐池1200多平米,开展了7000余份棉花种质资源的鉴定,该技术已成为我国“国家十三五重点研发计划”和“国家转基因重大专项”棉花耐盐碱鉴定的标准方法。参与中美棉花基因组计划,2012年以共同第一作者发表Nature Genetics论文“The draft genome of a diploid cottonGossypium raimondii” [2]  。率先以棉花发明一等奖品种—中棉所12为材料,挖掘其中所蕴含的优良农艺性状基因及相应的Haplotype Block(单元型模块),并揭示了Haplotype Block(单元型模块)在中棉所12后代品种中的遗传机理。通过基因芯片、差减文库、转录组测序等方法克隆了GhVP、GAPDH、GhSOS1、ZmPIS、ZmPLC1、TsVP、GmST1、GmST2、ApGSMT2、ApDMT2等一批与耐盐有关的基因,利用自主知识产权的“棉花第三代基因枪活体转化技术”获得了一批抗逆转基因材料植株1200余份,选育抗逆新品系8份。培养国内外硕士和博士研究生30多名。获得各类成果奖励4项,其中国家科技进步一等奖1项(2003);获得国际和国家授权专利20余项;植物新品种权1项,国家行业标准1项,软件著作权10多项。在Nature Genetics、Plant Biotechnology Journal、Frontiers in Plant Science、中国农业科学、作物学报等国内外学术刊物上发表学术论文80多篇,累计影响因子230以上,发表著作9部,为棉花功能基因组学研究和分子改良奠定了基础。

2. 教育经历:

2004.09–2007.06,中国农业科学院研究生院,作物遗传育种,博士

1998.09–2001.06,中国农业科学院研究生院,作物遗传育种,硕士

1986.09–1990.06,浙江农业大学(现为 浙江大学),农学,学士

3. 工作经历:

2013.01-至今,中国农业科学院棉花研究所,研究员三级岗位;

2009.01-至今,中国农业科学院棉花研究所,品种资源室,研究员;

2009.05-2009.12,美国农业部南方平原研究中心,德克萨斯州试验站,合作研究;

2001.02-2008.12,中国农业科学院棉花研究所,品种资源室,副研究员;

1995.02-2001.01,中国农业科学院棉花研究所,品种资源室,助理研究员;

1990.07-1995.01,中国农业科学院棉花研究所,品种资源室,研究实习员。

4. 承担项目:

(1) 十三五国家重点研发计划(2016ZX08005-004),转基因耐旱耐盐碱棉花新品种培育,2016.01-2020.12,子课题主持;

(2) 十三五国家重点研发计划(2016YFD0101400): 棉花品质、抗逆等重要性状的功能基因组与调控网络,2016.01-2020.12,子课题主持;

(3) 国家重点研发计划(2016YFD0101401): 棉花杂种优势利用技术与强优势杂交种创制,2016.01-2020.12,参加;

(4) 十三五国家重点研发计划(2016YFD0101006-10):棉花品质、抗逆等重要性状的功能基因组与调控网络,2016.01-2020.12,参加;

(5) 十三五国家重点研发计划(2016YFD0100203)棉花优异种质资源精准鉴定与创新利用,2016.01-2020.12,参加;

(6) 国家棉花产业技术体系(CARS-15-02),2021.01-2021.12,参加。

5. 代表论文与著作:

   论文:

(1) The draft genome of a diploid cotton Gossypium raimondii. Nature Genetics,2012,44(10):1098-1103.

(2) Genome sequence of cultivated Upland cotton (Gossypium hirsutum TM-1) provides insights into genome evolution. Nature Biotechnology, 2015, 33(5):524-530.

(3) Genome sequence of the cultivated cotton Gossypium arboretum, Nature Genetics, 2014,46, 567-574.

(4) Resequencing of cv CRI-12 family reveals haplotype block inheritance and recombination of agronomically important genes in artificial selection. Plant Biotechnology Journal. 2019, 17(5): 945-955.

(5) A novel raffinose biological pathway is observed by symbionts of cotton≡Verticillium dahliae to improve salt tolerance genetically on cotton. J Agro Crop Sci. 2021; 00: 1-14.

(6) Melatonin Improves Cotton Salt Tolerance by Regulating ROS Scavenging System and Ca2+ Signal Transduction. Front. Plant Sci. 2021, 12:693690.

(7) Insight Between the Epigenetics and Transcription Responding of Cotton Hypocotyl Cellular Elongation Under Salt-Alkaline Stress. Front. Plant Sci. 2021, 12: 772123.

(8) Molecular Traits and Functional Analysis of the CLAVATA3/Endosperm Surrounding Region-Related Small Signaling Peptides in Three Species of Gossypium Genus. Front. Plant Sci. 2021, 12:671626.

(9) Cotton transcriptome analysis reveals novel biological pathways that eliminate reactive oxygen species (ROS) under sodium bicarbonate (NaHCO3) alkaline stress. Genomics, 2021, 113: 1157-1169.

(10) Molecular characterization, expression and interaction of MAPK, MAPKK and MAPKKK genes in upland cotton. Genomics, 2021, 113: 1071-1086.

(11) Genome-wide identification of CK gene family suggests functional expression pattern against Cd2+ stress in Gossypium hirsutum L.. International Journal of Biological Macromolecules,2021, 188: 272-282.

(12) Transcriptome analysis of upland cotton revealed novel pathways to scavenge reactive oxygen species (ROS) responding to Na2SO4 tolerance. Scientific Reports, 2021: 11:8670.

(13) Exploring potential of copper and silver nano particles to establish efficient callogenesis and regeneration system for wheat (Triticum aestivum L.),GM Crops & Food,      2021, 1-23.

(14) Zinc finger transcription factor ZAT familygenes confer multi-tolerances in Gossypium hirsutum L.  Journal of Cotton Research. 2021,4:24.

(15) Genome-wide identification and function analysis of HMAD gene family in cotton (Gossypium spp.). BMC Plant Biology, 2021, 21:386.

(16) Differentially expressed bZIP transcription factors confer multi-tolerances in Gossypium hirsutum L. International Journal of Biological Macromolecules, 2020, 146: 569-578.

(17) Genome-wide expression analysis suggests glutaredoxin genes response to various stresses in cotton, International Journal of Biological Macromolecules, 2020, 153: 470-491.

(18) Genome-wide identification and expression analysis of PUB genes in cotton. BMC Genomics, 2020, 21:213.

(19) Temporal salt stress-induced transcriptome alterations and regulatory mechanisms revealed by PacBio long-reads RNA sequencing in Gossypium hirsutum. BMC Genomics, 2020, 21:838.

(20) Transcriptome analysis reveals cotton (Gossypium hirsutum) genes that are differentially expressed in Cadmium stress tolerance. International Journal of Molecular Sciences. 2019, 20(6):1479.

(21) Identification and function analysis of drought-specific small RNAs in Gossypium hirsutum L. Plant Science, 2019, 280: 187-196.

(22) Genome-wide characterization and expression profiling of the MAPKKK genes in Gossypium arboreum L. Genome, 2019, 62: 609-622.

(23) Genome-wide identification and expression analysis of DNA demethylase family in cotton, Journal of Cotton Research, 2019, 2(1).

(24) Transcriptome analysis of Gossypium hirsutum L. reveals different mechanisms among NaCl, NaOH and Na2CO3 stress tolerance. Scientific Reports, 2018, 8:13527.

(25) Identification, characterization, and expression patterns of TCP genes and microRNA319 in cotton. International Journal of Molecular Sciences, 2018, 19, 3655.

(26) Single-base resolution methylomes of upland cotton (Gossypium hirsutum L.) reveal epigenome modifications in response to drought stress. BMC Genomics, 2017, 18:297.

(27) Targeted mutagenesis in cotton (Gossypium hirsutum L.) using the CRISPR/Cas9 system. Scientific Reports, 2017, 7:44304.

(28) Genome-Wide Analysis of Long Noncoding RNAs and Their Responses to Drought Stress in Cotton (Gossypium hirsutum L.). PLoS One. 2016; 11(6): e0156723.

(29) Mining and Analysis of SNP in Response to Salinity Stress in Upland Cotton (Gossypium hirsutum L.). PLoS One. 2016; 11(6): e0158142.

(30) Genome-wide Identification and analysis of the stress-resistance function of the TPS (Trehalose-6-Phosphate Synthase) gene family in cotton. BMC Genetics. 2016, 17(1):1-11.

(31) Epigenetic mechanisms of salt tolerance and heterosis in Upland cotton (Gossypium hirsutum L.) revealed by methylation-sensitive amplified polymorphism analysis. Euphytica, 2016, 208:477-491.

(32) Genome-wide Identification and Structural Analysis of Pyrophosphatase Gene Family in Cotton. Crop Science, 2016, 56:1-10.

(33) The hairless  stem  phenotype  of  cotton  (G. barbadense)  is  linked  to  a copia-like retrotransposon insertion in homeodomain leucine zipper gene (HD1). Genetics,   2015, 201(1):143-154.

(34) Genome wide investigation and transcriptome analysis of the WRKY gene family in Gossypium. Molecular Genetics and Genomics, 2015, 290:151-171.

(35) Analysis of methylation-sensitive amplified polymorphism in different cotton accessions under salt stress based on capillary electrophoresis. Genes & Genomics. 2015, 37: 713-724.

(36) Whole-genome DNA methylation analysis in cotton (Gossypium hirsutum L.) under different salt stresses. Turk J. Biol.   2015,9, 396-406.

(37) The MAPKKK gene family in Gossypium raimondii: genome-wide identification, classification and expression analysis. International Journal of Molecular Sciences, 2013, 14, 18740-18757.

(38) Difference in miRNA expression profiles between two cotton cultivars with distinct salt sensitivity. Molecular Biology Reports. 2012, 39 (4): 4961-4970.

(39) Study on DNA Cytosine Methylation of Cotton (G. hirsutum L.)Genome and Its Implication for Salt Tolerance. Agricultural Science in China, 2010, 9 (6):783-791.

(40) 酵母耐盐相关基因HAL1在棉花中的功能表达. 中国农业科学, 2016, 49 (14) :2651-2661

(41) NaCl和Na2CO3对不同棉花基因组的DNA甲基化影响. 中国农业科学, 2014,47(16)3132-3142.

(42) 陆地棉干旱胁迫响应基因GhGR的克隆及特征分析. 中国农业科学,2012,45(8):1644-1652

(43) 陆地棉质体转录活性因子基因GhPTAC的克隆及其耐盐性分析. 作物学报,2011,37 (9):1551-1558.

(44) PEG胁迫条件下41份陆地棉种质资源萌发特性研究及其抗旱性综合评价. 植物遗传资源学报. 2011, 12 (6):840-846.

(45) 干旱胁迫下棉花SSH文库构建及其抗旱相关基因分析. 作物学报, 2010, 12: 2035-2044.

(46) 棉花耐盐相关种质资源遗传多样性,分子生物多样性. 2010,18(2):137-144.

(47) 棉花耐盐性的SSR标记研究. 棉花学报, 2010,22(2):175-180.

(48) 陆地棉耐盐相关基因(GhVP)的克隆与分析. 棉花学报, 2010,22(3): 285-288.

(49) 陆地棉萌发出苗期耐盐鉴定方法的研究及应用. 江苏农业科学, 2010, 2:87-88.

(50) 干旱胁迫下棉花SSH文库构建及其抗旱相关基因分析. 作物学报, 2010,36(12):1-10.

(51) 盐胁迫下陆地棉耐盐品种根系的抑制消减文库构建. 棉花学报, 2009,21(5):339-345.

(52) DNA甲基化与植物抗逆性研究进展. 西北植物学报, 2009,29(7):1479-1489

(53) 盐胁迫下棉花体内Na+的积累、分配及耐盐机制研究. 棉花学报, 2006, 18(5): 279-283.

(54) 棉田盐分速测法——饱和糊状土壤电导法. 中国棉花, 2000, 27 (6):32-32.

(55) 棉花种质资源耐盐性鉴定技术与应用. 中国棉花, 1998, 25(9):2.

(56) 世界棉花基因库现状. 中国棉花, 1995, 10: 37-38.

(57) 棉花半配合的受精生物学研究. 棉花学报,1995,7.3:4.

(58) 氯化钠和食用盐对棉花种子萌发的影响. 中国棉花,1994,21(3):14-15.

(59) 棉属A、D、AD基因组叶腺体类萜渐渗及其抗虫潜力(译). 棉花科学, 1994, (2):43.

(60) 陆地棉与澳洲2个野生棉杂种细胞学研究. 棉花学报,1994,(1):23-28.

(61) 特纳氏棉的核型研究. 中国棉花, 1993,1:14-15.

(62) 野生棉异地枝条引种方法简报. 中国棉花,1992,3(2):13-14.

著作:

(63)  《棉花逆境分子生物学》,2021,北京,光明日报出版社,主编

(64)  《棉花纤维发育生物学》,2016,北京,科学出版社,编委

(65)  《2013科学发展报告》, 2013,北京,科学出版社,编委           

(66)  《中国短季棉遗传育种学》,2007,北京,科学技术出版社,编委

(67)  《棉花种质资源描述规范和数据标准》,2005,北京,中国农业出版社,编委

(68)  《中国棉花遗传育种学》,2003,济南,科学技术出版社,编委

(69)  《棉花新品种及配套丰产技术》,2000,中国劳动社会保障出版社,编委

(70)  《中国棉花遗传资源及其性状》,1998,北京,中国农业出版社,编委

(71)  《棉花抗逆性及抗病虫鉴定技术》,1996,北京,中国农业出版社,副主编

6. 专利:

(1)  An expression vector and its application in transgenic plants,(RF 1763364),2020年1月获法国发明专利

(2)  一种用于目的基因干扰的RNA片段及其应用(ZL 2017 1 0075627.7),2021年8月17日获得国家发明专利

(3)  陆地棉GhLEA3基因及其在抗低温胁迫方面的应用(ZL 2018 1 0030680.X),2021年5月28日获得国家发明专利

(4)  一种棉花耐碱性的鉴定方法(ZL 2017 1 0803947.X),2020年4月28日获得国家发明专利

(5)  一种便携式摘棉机(ZL 2019 2 1782691. X),2020年10月23日获得实用新型专利

(6)  一种筛选棉花抗旱相关基因的方法(ZL 2017 1 0130526.5),2019年12月获国家发明专利

(7)  一种表达载体及其在培育转基因植物中的应用(ZL 2017 1 0120017.4),2019年11月29日获国家发明专利

(8)  一种棉花耐镉性的鉴定方法(ZL 2017 1 0803925.3),2019年6月18日获得国家发明专利

(9)  一种棉花子叶期抗冷鉴定方法(ZL 2015 1 0948563.8),2019年11月26日获得国家发明专利

(10) 一种基因枪用活塞样品架(ZL 2016 1 0349894.4),2017年12月19日获得国家发明专利

(11) 一种免去雄授粉装置及方法(ZL 2017 2 0542630.0),2017年12月15日获得实用新型专利

(12) 一种制备转GAPDH基因棉花的方法(ZL 2013 1 0396389.1),2016年3月30日获得国家发明专利

(13) 鉴定待测品种是否为瑞杂816的方法及专用引物组(ZL 2014 1 0245213.0),2016年6月22日获得国家发明专利

(14) 一种植物DNA的快速提取方法(ZL 2014 1 0188782.6), 2016年9月7日获得国家发明专利

(15) 基因枪用活塞样品架(ZL 2016 2 0476934.7),2016年5月24日获得实用新型专利

(16) 一种检测待测制种农户制备的棉花杂交种中是否有自交种的方法(ZL 2013 1 0574535.5),2016年3月2日获得国家发明专利     

(17) 一种鉴定耐盐棉花的方法及专用SSR标记(ZL 2011 1 0163907.6),2015年9月30日获得国家发明专利

(18) 鉴定待测品种是否为中棉所63的方法及其专用引物组(ZL 2013 1 0513600.3),2014年12月10日获得国家发明专利

7. 获得奖励:

(1) 国家科技进步一等奖1项(2003):中国农作物种质资源保存评价与利用(集体奖);

(2) 国家重点科技攻关计划重大科技成果1项(2001);

(3) 江西省科委鉴定成果1项(1999);

(4) 中国农业科学院二等奖1项(1993)。

8. 联系方式:

(1) 邮箱:yew158@163.com;yewuwei@caas.cn

(2) 通讯地址:河南安阳开发区黄河大道38号